康熙皇帝对某些地方官员实心救灾的行动给予理解和支持。
康熙九年(1670),淮安、扬州二府水灾，当地所存积谷已于去年用于赈济，有人提出暂时挪用正项钱粮，等劝输捐纳补还正项。户部按规定不同意动支正项，只同意将凤阳仓存米及捐输扣存各项银米散赈，如果不够用就劝谕全省各官设法捐输来解决。康熙皇帝得知此事后，先派廉能大臣前往调查，指示“果系被灾已甚，无以为生，即会同督抚一面将正项钱粮动用赈济；若系次灾，即照部议”,强调“务使民地沾实惠”。至十月，水灾更显严重，“黄淮交涨，堤岸冲决，百姓室庐多被淹没。夏麦未获登场，秋禾播种，水潆难施，民生失所”。康熙皇帝立即下令“准动正项钱粮，存积银米”。赈济灾民，并蠲免当地应征钱粮。至第二年，康熙得知淮扬水患仍很严重，又催令户部：“民为邦本，如斯困苦，岂可不速行拯救?”让“就近截留漕米，或动支何项银两，籴米给散饥民”。他直接下令“着截留漕粮六万石，并各仓米四万石”赈灾，并且“于各府州县分设米厂……使饥民无奔赴守候拥挤之患，然后计人给米，每日人各一升，每三日一放”。这样做，一石米可供一个人百日之用，万石米可养活一万人一百天，十万石米就可以救济十万人到秋天麦收之后。淮扬的水灾频繁地威胁着淮扬人民，而大量的淮扬人民却能在康熙皇帝的赈济政策下延续了生命，因此康熙皇帝被淮扬人民感戴若神明。