另一方面，从直观上看，创业板上的企业要远小于主板企业，业绩容易受到冲击。比如经济金融形势的变化，某一个行业景气度的变化，都可能影响到一个创业板企业，使其业绩产生大幅的波动。
从目前中小科技企业的特点来看，创业板上的企业还有经营上的风险。许多创业板上的企业，都特别依赖于某一核心技术，这些企业有些就是由科研人员拿某一项专利而设立的，对单一技术的依赖程度高，一旦出现替代性的技术，对企业的影响也比较大。
这些风险结合在一起，其体现就是创业板上的企业早夭的现象会比较显著。虽然创业板市场会以成长性区别于其他市场，但高成长性也仅仅是对于那些存留下来的企业而言。投资者选中的企业，可能获得高回报，也可能直接退市，并不会像多数主板绩差企业一样还存在一个“壳资源”。
如何选择创业板企业？创业板企业的特点与主板企业不同，创业板企业的投资和盈利可能不是线性的，盈利的增长也可能不是线性的。因此，在主板市场上采用的估值方法，放在创业板未必适用。另外，创业板市场的一些企业的商业模式可能是全新的，在市场上缺乏对比参照的模式，在定价上也会遇到困难。也就是说，在微观层面，定价和预期价格都是一件很困难的事情。