秦王嬴政，就这么做了秦始皇帝。早在一统的天下的过程中，秦国的中央机构就已经得到更好地确立：中央设立了丞相、太尉、御史三大夫。丞相负责政事，事务繁多，特加左右二员，帮着打理。太尉执掌军国大事，专理军队事务，具体调动军队，则只能权在皇帝。御史大夫是丞相的副手，掌管图籍秘书，监察百官。
在丞相、太尉、御史大夫以下，是分掌具体政务的诸卿，丞相、太尉、御史大夫与诸卿议论政务，最后由皇帝作出裁决。秦王朝建立的这套中央集权的政权机构，以后一直被历代王朝所仿效。其中汉代的“三公九卿”，基本上是照搬秦制。
除了中央集权机构的政权机构，始皇帝还采纳了李斯等人的建议，改分封制为郡县制。将地方行政机构分郡、县两级。郡县主要官吏由中央任免。郡以下设县，县以下还有乡，乡下又有里，此外还设司治安、禁盗贼的专门机构亭。
机构尽管如此完善，大小事情尽管都有人负责处理，可天下事无论是大小，还都得由他这个始皇帝来做出决定。为了确保对整个国家的控制，始皇帝只得拼命约束自己，每天批阅大量的公文、奏章。因为秦始皇感到生的荣耀已达到了巅峰，便非常地关心自己死后的生活待遇。在渭水之南骊山北面，他有一个行宫。这是始皇帝从十二岁继秦王位后就开始修建的自己死后住的地方，称为秦王陵，现在应该称做始皇帝陵。