思宗称帝时年仅17岁，不过他对目前的混乱局势非常清楚。他首先要铲除的就是天怒人怨的“客魏集团”。不过客氏和魏忠贤等人的势力太大，思宗根本不敢轻举妄动。他入住皇宫的当天，连干粮都自己带着，不敢碰宫中的任何食物，连晚上也抱着佩剑而卧，还一夜未眠。他就这样心惊胆战地度过了最初的几天。接着思宗一边将原来信王府的人员逐步带入宫中，开始培植自己的势力，一边优待客氏和魏忠贤，迷惑他们。魏忠贤摸不准思宗的心思，就进献了几个美人来讨好，想让思宗变成一个酒色君王。不料思宗根本不上当，却又继续优抚魏忠贤等人。魏忠贤就提出辞去东厂职务来试探思宗，思宗没有批准。魏忠贤还不放心，又怂恿客氏去向思宗请求出宫来再次试探，不料思宗爽快地同意了，客氏只好哭哭啼啼地出了紫禁城。
思宗赶走客氏后，就重用太监曹化淳等人，好与魏忠贤抗衡。思宗虽然做得不动声色，但朝中很多魏忠贤的党羽都感觉到形势要变，他们为了保全自己，纷纷寻找出路，这样魏忠贤集团就出现了分化。思宗还没有动手，魏忠贤集团就起了内讧，阉党的几个首恶分子互相弹劾，思宗则继续沉默。没过多久，阉党之外的一些官员也行动起来，他们弹劾魏忠贤专权和造生祠之罪，思宗继续不做任何举动。魏忠贤腹背受敌，自己也乱了阵脚，崇祯元年（1628年）十月，他以患病为由，主动辞去东厂职务，思宗立即批准了。十一月一日，思宗就下诏公布了魏忠贤的罪行。不过鉴于先帝熹宗还未出殡，就暂将魏忠贤安置在凤阳，等候处分。接着思宗就籍没客、魏二主犯的家产，收回以前赐给他们的封爵。十一月六日，被押往凤阳的魏忠贤在半路上吊自杀了。第二天，客氏也被押往浣衣居杖毙。随后，客、魏两家的子孙也都被斩首了。思宗称帝才1年多，就铲除了为恶多年的“客魏集团”，可见他很有执政手段。